Антон Заболотный начал заниматься футболом в школе местного «Металлурга». В 13-летнем возрасте перешел в ЦСКА, где выступал за молодежной командой и привлекался к работе с основным составом. В 2010 году на правах аренды перешел в «Волгарь-Газпром», в 2011 — в «Урал», в 2012 — в брянское «Динамо», после чего снова вернулся в Москву.
С 2013 года Заболотный играл в «Уфе», затем — в воронежском «Факеле», а в 2016 году переехал в Ленинградскую область и присоединился к «Тосно», где в первом же сезоне стал лучшим бомбардиром клуба.
В текущем сезоне российской Премьер-Лиги Антон Заболотный принял участие в 19 матчах, забил 4 гола и отдал 2 результативные передачи.
Официально: Антон Заболотный продолжит карьеру в «Зените»!
— ФК «Зенит» (@zenit_spb) December 12, 2017
Подробности: https://t.co/XpFNtMQAuq pic.twitter.com/9b1YwBr90g